En tant qu'université privée, Constructor University est indépendante du contrôle gouvernemental de sa mission, de son orientation stratégique et de ses ressources. Constructor University est régie par un conseil d'administration indépendant qui agit en tant que fiduciaire des ressources et de la mission de l'institution. Le conseil d'administration de la Constructor University est composé de personnalités du monde des affaires internationales, de la politique et du milieu universitaire.
Le conseil d'administration est chargé de surveiller la mise en œuvre des principes directeurs de Constructor University, d'assurer des ressources adéquates pour le fonctionnement de l'université et d'approuver les budgets et les recommandations de personnel proposés par le président. Le président est responsable de toutes les opérations administratives et académiques de l'université.